In questa nuova avventura i piccoli esserini blu, i Puffi, dovranno vedersela con il mondo reale. Il loro acerrimo nemico, Gargamella, escogita un complotto insieme a suo fratello Razamella. I due riescono a rapire il Grande Puffo! I puffi organizzano una missione di salvataggio, guidata dall'intrepida Puffetta per salvare il loro leader. Per ritrovarlo i puffi saranno costretti a oltrepassare la soglia del loro mondo e arrivare nel mondo reale.

Quella che era partita come una missione di soccorso si trasforma in un viaggio epico alla ricerca della loro identità, per salvare non soltanto il Grande Puffo ma l'interno universo, in pericolo per via di Razamella che vuole usare i Quattro Libri Magici per i suoi scopi.

Durante quest'epica avventura, i nostri amici puffi incontreranno diversi personaggi che li aiuteranno, come Mamma Poot e un Puffo senza Nome, che è alla ricerca della sua identità. Senza saperlo, questo Puffo, è esattamente quello di cui avevano bisogno per salvare il Grande Puffo e fermare Razamella dal compiere il suo piano malefico.